การค้นหาจีโนมของเซลล์มะเร็ง

สิ่งเหล่านี้จะไม่สามารถฆ่ามะเร็งได้หากเซลล์ภูมิคุ้มกันไม่รู้จัก ‘ป้ายบอกทาง’ ที่ทำเครื่องหมายว่าเซลล์มะเร็งเป็นต่างประเทศ กลุ่มทั่วโลกกำลังค้นหาสิ่งเหล่านี้เช่นเปปไทด์ที่กลายพันธุ์ซึ่งเรียกว่านีโอแอนติเจนบนเยื่อชั้นนอกของเซลล์มะเร็ง การระบุเปปไทด์เฉพาะที่นำเสนอตัวเองไปยังเซลล์ T สามารถช่วยพัฒนาวัคซีนมะเร็งในแบบของคุณขึ้นอยู่กับโปรไฟล์ใหม่ของแอนติเจน

หนึ่งในปัญหาในการค้นพบแอนติเจนในมะเร็งเช่น melanoma ก็คือโปรตีนเหล่านี้ถูกนำเสนอโดยโปรตีนที่เรียกว่า HLA ซึ่งเป็นคอมเพล็กซ์ที่สามารถเกิดขึ้นได้ในหลายพันรุ่นแม้ว่าจะไม่มีการกลายพันธุ์ของมะเร็งก็ตาม แท้จริงแล้วอัลกอริทึมที่มักใช้ในการค้นหาจีโนมของเซลล์มะเร็งสำหรับแอนติเจนนีโอที่เป็นไปได้คาดการณ์ผู้สมัครนับร้อย ๆ